<HTML>

Alvina D' Silva wrote:

<BLOCKQUOTE TYPE=CITE>Hi all!

<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; I did'nt receive any answers, so I thought

I'd repost the questions

<P>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Please Help me !!!!

<P>1.&nbsp;&nbsp;&nbsp; I was trying out the examples&nbsp; - "Medical*.cxx"

which use contour filters .

<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp; These filters as well as marching cubes ask the

value range ( 'SetValue' method). While values like

<BR>500(skin extraction) &amp; 1150(bone extraction) work fine for the

sample images, they do not hold good for all.

<BR>Some of my MR images needed values of 30000 for bone extraction !

<P>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Is there no limited value range which will hold good

for different sets of images? ( This is essential, since

<BR>users will be asked to input this value ). Or is there any other way

about this&nbsp; (without specifying values ) ?

<P>2. Given a set of Images(x-y), what classes do I use &amp; how do I

use them to obtain the other coordinate axes( viz x-z &amp; y-z )?

<P>3.&nbsp;&nbsp; Is there any way I can increase the speed of execution

(other than decimate)&nbsp; ?&nbsp; I'm on windows NT &amp;

<BR>am using VC++.

<P>4. How do I close the openGL window without closing my main window ?

<P>5. Does vtkImageReader support raw files? (tried to read some bin files

but was unsuccessful)

<P>Would be grateful if someone could help ,

<BR>Alvina

<BR>&nbsp;</BLOCKQUOTE>

I'll take a shot at answering your questions.

<P>&nbsp;1)&nbsp; In general, if the image data doesn't conform to any

standard, you need to pick a value

<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; to segment your data.&nbsp; This

is frequently done using a histogram.&nbsp; If two materials are

<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; represented by two peaks in the

histogram, you can choose the value at the low point

<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; between the peaks as the contour

value.&nbsp; Much more sophisticated techniques can be

<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; used.&nbsp; (If your data is supposed

to conform to some medical standard,&nbsp; I can't answer

<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; your question.)

<P>&nbsp; 2)&nbsp; You can use vtkImageReslice.

<P>&nbsp; 3)&nbsp;&nbsp; Be sure to use vtkStripper since most hardware

processes "triangle strips" faster.

<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Also,&nbsp; using

vtkProperty with BackfaceCullingOn may help since triangles that

<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; aren't visible

won't be processed by the rendering hardware.

<P>&nbsp;&nbsp; 4)&nbsp; I don't understand this question.&nbsp; I normally

only have one window.

<P>&nbsp;&nbsp; 5)&nbsp; Yes.&nbsp; e.g.

<P>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;

vtkImageReader reader

<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;

reader SetDataExtent 0 999 0 999 0 499

<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;

reader SetDataVOI 100 769 100 869 0 499

<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;

reader SetFilePrefix "0629001/0629001.rec"

<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;

reader SetFilePattern "%s%4.4d.img"

<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;

reader SetDataScalarType $VTK_SHORT

<P>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; If you

are looking at data with your NT machine which was orginally made on a

non-Intel

<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; (probably

Unix) machine you'll need to also use

<P>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;

reader SetDataByteOrderToBigEndian

<BR>&nbsp;

<P>Dave

<P>&nbsp;

<PRE>--&nbsp;

David E Jones

Du Pont Central Research

Experimental Station, Bldg 320

Wilmington, DE 19880-0320</PRE>

&nbsp;</HTML>