<div>In the COMSOL software, there is a mesher. I use the mesher in COMSOL for creating mesh. I do not specify the number of meshes. I just increase the mesh density near the electrodes. I do not mention anywhere the number of meshes. But obviously, the number of points in the vtk file is dependent upon the number of mesh created in COMSOL.</div>

<div> </div>
<div>On Fri, Oct 30, 2009 at 10:40 PM, Bill Lorensen <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:bill.lorensen@gmail.com">bill.lorensen@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br></div>
<div class="gmail_quote">
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">How is the mesh created? Do you specify the number of tetrahedra or<br>are they used for the analysis?<br>

<div>
<div></div>
<div class="h5"><br>On Fri, Oct 30, 2009 at 6:11 PM, Sanket Jain &lt;<a href="mailto:jainsanket1@gmail.com">jainsanket1@gmail.com</a>&gt; wrote:<br>&gt; I did not understand what you meant by conversion. I assume you meant<br>
&gt; converting my geometry and data into vtk file. Below is a description of<br>&gt; what I am doing. Maybe this helps to narrow down the problem.<br>&gt;<br>&gt; Actually there is no comsol file format. COMSOL is a software which can be<br>
&gt; linked with MATLAB (Like a toolbox; but its a seperate software). I create<br>&gt; my FEM model in COMSOL and compute the solutions. Since, MATLAB and COMSOL<br>&gt; are connected, I can take the mesh points, connections and solutions<br>
&gt; (scalars) from COMSOL and save them as .vtk file (unstructured grid) using<br>&gt; my custom .m file (attached).<br>&gt;<br>&gt; Also, I have another custom method of solving the FEM problem which is also<br>&gt; MATLAB based. So, for 1 problem I have 2 sets of scalars and one set of mesh<br>
&gt; points and connections (geometry). I save vtk file from the scalars from<br>&gt; alternate method using the same . m file<br>&gt;<br>&gt; Therefore, I have 2 vtk files (both unstructured grid) with same geometry<br>&gt; but different scalars. But, when I visualise both of them in VTK (and<br>
&gt; paraview), I have these rough surfaces.<br>&gt;<br>&gt; I am attaching both these vtk files for your reference. Also, I am attaching<br>&gt; .m file which reads a .mat file (either data_COMSOL or data_CUSTOM) and<br>
&gt; writes these corresponding .vtk files.<br>&gt;<br>&gt; Let me know if I have confused you. I will be happy to clarify my<br>&gt; explanation.<br>&gt;<br>&gt; Sanket Jain<br>&gt;<br>&gt; On Fri, Oct 30, 2009 at 3:51 PM, Sanket Jain &lt;<a href="mailto:jainsanket1@gmail.com">jainsanket1@gmail.com</a>&gt; wrote:<br>
&gt;&gt;<br>&gt;&gt; No the comsol file is not open format. You will require COMSOL software to<br>&gt;&gt; view it. Anyways, I will check the scalar values and then if the problem<br>&gt;&gt; still persists, i will update you with my work.<br>
&gt;&gt;<br>&gt;&gt; Sanket<br>&gt;&gt;<br>&gt;&gt; On Fri, Oct 30, 2009 at 2:11 PM, Bill Lorensen &lt;<a href="mailto:bill.lorensen@gmail.com">bill.lorensen@gmail.com</a>&gt;<br>&gt;&gt; wrote:<br>&gt;&gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; So, my guess is that there is something wrong in your conversion. Is<br>
&gt;&gt;&gt; the comsol file format an open format? Is there a description? If so,<br>&gt;&gt;&gt; can you provide the comsol file you are trying to convert?<br>&gt;&gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; Bill<br>&gt;&gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; On Fri, Oct 30, 2009 at 1:22 PM, Sanket Jain &lt;<a href="mailto:jainsanket1@gmail.com">jainsanket1@gmail.com</a>&gt;<br>
&gt;&gt;&gt; wrote:<br>&gt;&gt;&gt; &gt; Yes, I generated the isosurface in comsol. It looks smoother than in<br>&gt;&gt;&gt; &gt; VTK. I<br>&gt;&gt;&gt; &gt; have attached an view for the isosurface. It looks similar when I<br>
&gt;&gt;&gt; &gt; rotate the<br>&gt;&gt;&gt; &gt; isosurface for different view.<br>&gt;&gt;&gt; &gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt; Sanket<br>&gt;&gt;&gt; &gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt; On Fri, Oct 30, 2009 at 12:13 PM, Bill Lorensen<br>
&gt;&gt;&gt; &gt; &lt;<a href="mailto:bill.lorensen@gmail.com">bill.lorensen@gmail.com</a>&gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt; wrote:<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; The file and data seem OK. I looked at it in paraview and I see the<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; same sort of &quot;rough&quot; isosurfaces that you see.  Can you generate an<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; isosurface in COMSOL for comparison?<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; Bill<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt;<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; On Fri, Oct 30, 2009 at 12:36 PM, Bill Lorensen<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &lt;<a href="mailto:bill.lorensen@gmail.com">bill.lorensen@gmail.com</a>&gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; wrote:<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; If the outside of your mesh is a &quot;box&quot;, that is all you will see.<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; I&#39;ll take a look.<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; Bill<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; On Fri, Oct 30, 2009 at 12:27 PM, Sanket Jain<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &lt;<a href="mailto:jainsanket1@gmail.com">jainsanket1@gmail.com</a>&gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; wrote:<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; When I open the unstructured grid file in paraview, I get a opaque<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; border of<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; my geometry. When I decrease the opacity, I just see a hollow box.<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; I<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; cannot<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; see my mesh inside the box. I think there is some problem with the<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; file. But<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; I compared my file with the format for writing unstructured grid<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; and it<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; looks correct to me. Do you mind having a look at the file<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; (attached)?<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; I<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; know this might be asking for too much help. I really appreciate<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; your<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; efforts to help me.<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; Sanket<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; On Fri, Oct 30, 2009 at 11:17 AM, Bill Lorensen<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &lt;<a href="mailto:bill.lorensen@gmail.com">bill.lorensen@gmail.com</a>&gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; wrote:<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; I mean the unstructured grid (the geometry).<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; On Fri, Oct 30, 2009 at 12:10 PM, Sanket Jain<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &lt;<a href="mailto:jainsanket1@gmail.com">jainsanket1@gmail.com</a>&gt;<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; wrote:<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt; Ok. I will recheck my matlab program which writes the vtk file<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt; and<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt; get<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt; back<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt; to you.<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt; For Paraview, did you mean only the mesh points without the<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt; scalar<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt; values? I<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt; checked the unstructured grid with scalars on them. They look<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt; exactly<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt; the<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt; same as in my VTK code.<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt; Sanket<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt; On Fri, Oct 30, 2009 at 7:55 AM, Bill Lorensen<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt; &lt;<a href="mailto:bill.lorensen@gmail.com">bill.lorensen@gmail.com</a>&gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt; wrote:<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; Perhaps your scalar values are not associated with the proper<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; points?<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; Have you looked at the original unstructured grid with<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; paraview?<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; On Thu, Oct 29, 2009 at 10:21 PM, Sanket Jain<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &lt;<a href="mailto:jainsanket1@gmail.com">jainsanket1@gmail.com</a>&gt;<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; wrote:<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; Yes, I tried for number of isovalues. But all of them have<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; similar<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; characteristics. Is it anything to do with the vtk file being<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; in<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; unstructured grid rather than polygonal data? For the mesh, I<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; imported<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; from<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; COMSOL, I cannot use polygonal data.<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; Sanket Jain<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; On Thu, Oct 29, 2009 at 6:33 PM, Bill Lorensen<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &lt;<a href="mailto:bill.lorensen@gmail.com">bill.lorensen@gmail.com</a>&gt;<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; wrote:<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; It does look strange. Have you tried changing the isosurface<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; value?<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; On Thu, Oct 29, 2009 at 5:44 PM, Sanket Jain<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &lt;<a href="mailto:jainsanket1@gmail.com">jainsanket1@gmail.com</a>&gt;<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; wrote:<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; I have attached a snapshot of my viewer. The isosurface is<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; predicting<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; the<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; volume activated during monopolar stimulation. So,<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; theoretically<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; you<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; will<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; expect a sphere at a particular iso value.<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; I tried using vtkPolyDataNormals. The figure attached is<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; the<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; output<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; after<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; including this filter. But I still think this is not<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; smooth.<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; I verified by opening my vtk file in Paraview (with,<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; Compute<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; Normal<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; ON).<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; Even then i get the same kind of response. So, do you<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; think<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; this<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; is<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; the<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; best<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; i can get? Or there might be some problem in the vtk file<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; which is<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; exported<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; from COMSOL (I verified it multiple times).<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; Thank you,<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; Sanket<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; On Thu, Oct 29, 2009 at 4:01 PM, Bill Lorensen<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &lt;<a href="mailto:bill.lorensen@gmail.com">bill.lorensen@gmail.com</a>&gt;<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; wrote:<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; Sorry, reading your e-mail in more detail. Are you<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; generating<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; the<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; isosurfaces in vtk using vtkContourFIiter or some<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; equivalent.<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; If<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; so,<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; you should run the output through vtkPolyDataNormals.<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; On Thu, Oct 29, 2009 at 4:59 PM, Bill Lorensen<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &lt;<a href="mailto:bill.lorensen@gmail.com">bill.lorensen@gmail.com</a>&gt;<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; wrote:<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; What do you mean by rough? Perhaps the faces are flat<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; shaded?<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; How<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; are<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; you displaying the model in vtk?<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; Are your isosurfaces composed of only triangles? If so,<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; did<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; you<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; provide surface normals at each point?<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; On Thu, Oct 29, 2009 at 4:30 PM, Sanket Jain<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &lt;<a href="mailto:jainsanket1@gmail.com">jainsanket1@gmail.com</a>&gt;<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; wrote:<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; Hello Experts,<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; I have just started to use VTK to fulfill my<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; visualization<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; needs.<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; I<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; am<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; trying out few fundamental steps which would be<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; crucial<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; for my<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; future<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; development.<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; I exported an  Finite Element Model (FEM) from COMSOL<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; and<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; wrote<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; it<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; as<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; vtk<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; unstructured grid in matlab (points, connections and<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; data). I<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; am<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; just<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; trying<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; to read my vtk file and trying to visualize the<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; isosurfaces at<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; some<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; value.<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; The problem is the isosurfaces are very rough even<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; when I<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; increased<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; the<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; mesh<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; density in my COMSOL model. I tried to perform the<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; same<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; task<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; in<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; paraview and<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; even there i saw the same problem.<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; Do you think that increasing the mesh density should<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; solve<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; it?<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; I<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; cannot<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; increase the mesh density because of computational<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; issues.<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; Any<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; ideas<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; on<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; this<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; problem will be appreciated.<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; Thank you,<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; Sanket Jain<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; _______________________________________________<br>
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&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; --<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt; Sanket Jain<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; &gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; --<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; Sanket Jain<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt; --<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt; Sanket Jain<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;&gt; &gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;<br>
&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; --<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt; Sanket Jain<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt;<br>&gt;&gt;&gt; &gt; --<br>
&gt;&gt;&gt; &gt; Sanket Jain<br>&gt;&gt;&gt; &gt;<br>&gt;&gt;<br>&gt;&gt;<br>&gt;&gt;<br>&gt;&gt; --<br>&gt;&gt; Sanket Jain<br>&gt;<br>&gt;<br>&gt;<br>&gt; --<br>&gt; Sanket Jain<br>&gt;<br></div></div></blockquote></div>
<br><br clear="all"><br>-- <br>Sanket Jain<br>