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<div class=WordSection1>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'>Thank you so much for your warmhearted help! My code is kind of
huge. Let me explain briefly: the program is coded for segmentation using ITK, visualization
by VTK, and interface by QT. It consists of image loading, diffusion filtering,
then fast marching segmentation using diffusion filtering output as input. I
attach the code here and hope you guys can help me to find inappropriate part.
Thank you very much in advance!<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New";color:green'>//connect vtk to itk<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New";color:blue'>template</span><span style='font-size:
10.0pt;font-family:"Courier New"'> &lt;<span style='color:blue'>typename</span>
ITK_Exporter, <span style='color:blue'>typename</span> VTK_Importer&gt;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New";color:blue'>void</span><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'> ConnectPipelines(ITK_Exporter exporter,
VTK_Importer* importer)<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>{<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'> 
importer-&gt;SetUpdateInformationCallback(exporter-&gt;GetUpdateInformationCallback());<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'> 
importer-&gt;SetPipelineModifiedCallback(exporter-&gt;GetPipelineModifiedCallback());<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'> 
importer-&gt;SetWholeExtentCallback(exporter-&gt;GetWholeExtentCallback());<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  importer-&gt;SetSpacingCallback(exporter-&gt;GetSpacingCallback());<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'> 
importer-&gt;SetOriginCallback(exporter-&gt;GetOriginCallback());<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'> 
importer-&gt;SetScalarTypeCallback(exporter-&gt;GetScalarTypeCallback());<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'> 
importer-&gt;SetNumberOfComponentsCallback(exporter-&gt;GetNumberOfComponentsCallback());<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'> 
importer-&gt;SetPropagateUpdateExtentCallback(exporter-&gt;GetPropagateUpdateExtentCallback());<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'> 
importer-&gt;SetUpdateDataCallback(exporter-&gt;GetUpdateDataCallback());<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'> 
importer-&gt;SetDataExtentCallback(exporter-&gt;GetDataExtentCallback());<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  importer-&gt;SetBufferPointerCallback(exporter-&gt;GetBufferPointerCallback());<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'> 
importer-&gt;SetCallbackUserData(exporter-&gt;GetCallbackUserData());<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New"'>}</span><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New"'><o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New";color:green'>//Paramter definiation<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New";color:blue'>#define</span><span style='font-size:
10.0pt;font-family:"Courier New"'> N_SEEDS 11<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New";color:blue'>typedef</span><span style='font-size:
10.0pt;font-family:"Courier New"'>    <span style='color:blue'>float</span>   
InputPixelType;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New";color:blue'>typedef</span><span style='font-size:
10.0pt;font-family:"Courier New"'>    <span style='color:blue'>float</span>   
OutputPixelType;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New";color:blue'>typedef</span><span style='font-size:
10.0pt;font-family:"Courier New"'> itk::Image&lt; InputPixelType,  3 &gt;  
InputImageType;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New";color:blue'>typedef</span><span style='font-size:
10.0pt;font-family:"Courier New"'> itk::Image&lt; OutputPixelType, 3 &gt;  
OutputImageType;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New";color:blue'>typedef</span><span style='font-size:
10.0pt;font-family:"Courier New"'> itk::ImageSeriesReader&lt; InputImageType
&gt;     ReaderType;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>ReaderType::Pointer reader = ReaderType::New();<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New";color:blue'>typedef</span><span style='font-size:
10.0pt;font-family:"Courier New"'> itk::GDCMImageIO                       
ImageIOType;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New";color:blue'>typedef</span><span style='font-size:
10.0pt;font-family:"Courier New"'> itk::GDCMSeriesFileNames               
NamesGeneratorType;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>ImageIOType::Pointer gdcmIO = ImageIOType::New();<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>NamesGeneratorType::Pointer namesGenerator =
NamesGeneratorType::New();</span><span style='font-size:10.0pt;font-family:
"Courier New"'><o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-indent:12.0pt;text-autospace:none'><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New";color:blue'>typedef</span><span style='font-size:
10.0pt;font-family:"Courier New"'> itk::VTKImageExport&lt; OutputImageType &gt;
ExportFilterType;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New";color:blue'>typedef</span><span style='font-size:
10.0pt;font-family:"Courier New"'> itk::RescaleIntensityImageFilter&lt; <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>             OutputImageType, InputImageType &gt;
RescaleFilterType;</span><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New"'><o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>RescaleFilterType::Pointer rescaler =
RescaleFilterType::New();</span><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New"'><o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New";color:blue'>typedef</span><span style='font-size:
10.0pt;font-family:"Courier New"'> itk::BinaryThresholdImageFilter&lt;
InputImageType, <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New"'>                   
OutputImageType    &gt;    ThresholdingFilterType;</span><span
style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'><o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>SimpleView::SimpleView() <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>{<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:blue'>this</span>-&gt;ui = <span
style='color:blue'>new</span> Ui_SimpleView;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-indent:12.0pt'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New";color:blue'>this</span><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>-&gt;ui-&gt;setupUi(<span style='color:blue'>this</span>);</span><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New"'><o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New";color:green'>  </span><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New";color:green'>// Set up action signals and slots<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-indent:12.0pt'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>connect(<span style='color:blue'>this</span>-&gt;ui-&gt;actionOpen,
SIGNAL(triggered()), <span style='color:blue'>this</span>, SLOT(slotOpen()));</span><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New"'> <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-indent:12.0pt'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>connect(<span style='color:blue'>this</span>-&gt;ui-&gt;pushButton_14,
SIGNAL(clicked()), <span style='color:blue'>this</span>, SLOT(slotContour()));</span><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New"'><o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New"'>};</span><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New"'><o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New";color:blue'>void</span><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'> SimpleView::slotOpen()<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>{<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  QString directory =
QFileDialog::getExistingDirectory(this,<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â tr(&quot;Choose
a directory&quot;), QDir::currentPath());<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New";color:green'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  namesGenerator-&gt;SetInputDirectory(directory); <span
style='color:green'><o:p></o:p></span></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:blue'>const</span>
ReaderType::FileNamesContainer &amp; filenames = <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>                           
namesGenerator-&gt;GetInputFileNames();<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:blue'>unsigned</span> <span
style='color:blue'>int</span> numberOfFilenames =  filenames.size();<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  std::cout &lt;&lt; numberOfFilenames &lt;&lt; <span
style='color:#A31515'>&quot; images loaded&quot;</span> &lt;&lt; std::endl; <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:blue'>for</span>(<span
style='color:blue'>unsigned</span> <span style='color:blue'>int</span> fni = 0;
fni&lt;numberOfFilenames; fni++)<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>    {<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>    std::cout &lt;&lt; <span style='color:#A31515'>&quot;filename
# &quot;</span> &lt;&lt; fni &lt;&lt; <span style='color:#A31515'>&quot; =
&quot;</span>;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>    std::cout &lt;&lt; filenames[fni] &lt;&lt; std::endl;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>    }<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  reader-&gt;SetImageIO( gdcmIO );<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  reader-&gt;SetFileNames( filenames );<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:green'>//reader-&gt;Update();<o:p></o:p></span></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New";color:green'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New";color:green'>  //Diffusion filter<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:blue'>typedef</span>
itk::GradientAnisotropicDiffusionImageFilter&lt;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>               InputImageType, OutputImageType &gt; 
FilterType;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  FilterType::Pointer filter = FilterType::New();<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  filter-&gt;SetInput( reader-&gt;GetOutput() );<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:green'>// Set parameters for
diffusion filter<o:p></o:p></span></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:blue'>const</span> <span
style='color:blue'>unsigned</span> <span style='color:blue'>int</span>
numberOfIterations = 5;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:blue'>const</span> <span
style='color:blue'>double</span>       timeStep = 0.0625;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:blue'>const</span> <span
style='color:blue'>double</span>       conductance = 3;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  filter-&gt;SetNumberOfIterations(
numberOfIterations );<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  filter-&gt;SetTimeStep( timeStep );<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  filter-&gt;SetConductanceParameter( conductance );<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  filter-&gt;Update();<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  RescaleFilterType::Pointer rescaler =
RescaleFilterType::New();<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  rescaler-&gt;SetOutputMinimum(   0 );<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  rescaler-&gt;SetOutputMaximum( 255 );<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-indent:12.0pt'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>rescaler-&gt;SetInput( filter-&gt;GetOutput() );</span><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New"'><o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New"'>}</span><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New"'><o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New";color:blue'>void</span><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'> SimpleView::slotContour() {<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>      <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:blue'>long</span> <span
style='color:blue'>int</span> seed_points[N_SEEDS][3] = {<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>                                                            {     186, 
206, 138    },<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>                                                            {     138, 
218, 124    },<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>                                                            {     226, 
201, 124    },<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>                                                            {     309, 
220, 124    },<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>                                                            {     147, 
305, 83     },<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>      Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â  </span><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New"'>                  </span><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New"'>{     111,  228, 83     },<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>                                                            {     171, 
176, 83     },<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>                                                            {     245, 
178, 83     },<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>                                                            {     202, 
243, 83     },<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>                                                            {     112, 
242, 45     },<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>                                                            {     98, 
253, 7 }           Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â  <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>                                                      Â 
};<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'> <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:blue'>const</span>
InputPixelType  timeThreshold = 85;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  ThresholdingFilterType::Pointer thresholder1 =
ThresholdingFilterType::New();<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  thresholder1-&gt;SetLowerThreshold(           0.0 
);<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  thresholder1-&gt;SetUpperThreshold( timeThreshold 
);<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  thresholder1-&gt;SetOutsideValue(  0  );<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  thresholder1-&gt;SetInsideValue(  255 );<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:blue'>typedef</span>  
itk::GradientMagnitudeRecursiveGaussianImageFilter&lt; <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>                               InputImageType, <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>                               InputImageType &gt; 
GradientFilterType;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:blue'>typedef</span>  
itk::SigmoidImageFilter&lt;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>                               InputImageType, <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>                               InputImageType &gt; 
SigmoidFilterType;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  GradientFilterType::Pointer  gradientMagnitude =
GradientFilterType::New();<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  SigmoidFilterType::Pointer sigmoid =
SigmoidFilterType::New();<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  sigmoid-&gt;SetOutputMinimum(  0.0  );        <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  sigmoid-&gt;SetOutputMaximum(  1.0  );        <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:blue'>typedef</span> 
itk::FastMarchingImageFilter&lt; InputImageType, <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>                              InputImageType &gt;   
FastMarchingFilterType;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  FastMarchingFilterType::Pointer  fastMarching =
FastMarchingFilterType::New();<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  gradientMagnitude-&gt;SetInput( </span><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New"'>rescaler</span><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New"'>-&gt;GetOutput() );</span><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New"'> </span><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:green'>// using
rescaler from diffusion filter as input </span><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  sigmoid-&gt;SetInput( gradientMagnitude-&gt;GetOutput()
);<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  fastMarching-&gt;SetInput( sigmoid-&gt;GetOutput()
);<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  thresholder1-&gt;SetInput(
fastMarching-&gt;GetOutput() );<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:green'>//thresholder1-&gt;Update();<o:p></o:p></span></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New";color:green'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:blue'>const</span> <span
style='color:blue'>double</span> sigma = 1.3;                 <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  gradientMagnitude-&gt;SetSigma(  sigma  );<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:blue'>const</span> <span
style='color:blue'>double</span> alpha =  -0.05;                 <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:blue'>const</span> <span
style='color:blue'>double</span> beta =  0.3;              <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  sigmoid-&gt;SetAlpha( alpha );<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  sigmoid-&gt;SetBeta(  beta  );<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:blue'>typedef</span>
FastMarchingFilterType::NodeContainer           NodeContainer;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:blue'>typedef</span>
FastMarchingFilterType::NodeType   Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â NodeType;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  NodeContainer::Pointer seeds =
NodeContainer::New();<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  InputImageType::IndexType  seedPosition,
seedPosition2;   <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:blue'>const</span> <span
style='color:blue'>double</span> initialDistance = 2.0;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  NodeType node, node1, node2;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:blue'>const</span> <span
style='color:blue'>double</span> seedValue = -1*initialDistance;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>      <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:blue'>for</span> (<span
style='color:blue'>int</span> i = 0; i&lt;N_SEEDS; i++)   {<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  Â Â Â  seedPosition[0] = seed_points[i][0];<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  Â Â Â  seedPosition[1] = seed_points[i][1];<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  Â Â Â  seedPosition[2] = seed_points[i][2];<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  Â Â Â  node.SetValue( seedValue );<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  Â Â Â  node.SetIndex( seedPosition );<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  Â Â Â  seeds-&gt;InsertElement( i, node );<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  Â Â Â  std::cout &lt;&lt; <span style='color:#A31515'>&quot;Seed
Position &quot;</span> &lt;&lt; seedPosition &lt;&lt; std::endl;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  }<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  fastMarching-&gt;SetTrialPoints(  seeds  );<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  fastMarching-&gt;SetOutputSize( <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>          
reader-&gt;GetOutput()-&gt;GetBufferedRegion().GetSize() );<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:blue'>const</span> <span
style='color:blue'>double</span> stoppingTime = 100;<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  fastMarching-&gt;SetStoppingValue(  stoppingTime 
);<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  ExportFilterType::Pointer itkExporter2 =
ExportFilterType::New();<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>    <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  itkExporter2-&gt;SetInput(
thresholder1-&gt;GetOutput() );<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  vtkImageImport* vtkImporter2 =
vtkImageImport::New();  <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  ConnectPipelines(itkExporter2, vtkImporter2);<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'> <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  vtkImageViewer2 *imageViewer =
vtkImageViewer2::New();<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:blue'>this</span>-&gt;ui-&gt;qvtkWidget-&gt;SetRenderWindow(imageViewer-&gt;GetRenderWindow());<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  vtkRenderWindowInteractor *iren =
vtkRenderWindowInteractor::New();<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  imageViewer-&gt;SetupInteractor(iren);<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'> 
imageViewer-&gt;SetInput(vtkImporter2-&gt;GetOutput());<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  imageViewer-&gt;SetColorLevel(127);<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  imageViewer-&gt;SetColorWindow(255);<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'> <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  imageViewer-&gt;Render();<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  imageViewer-&gt;GetRenderer()-&gt;ResetCamera();<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  vtkSliderRepresentation2D *SliderRepres =
vtkSliderRepresentation2D::New();<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:blue'>int</span> min =
imageViewer-&gt;GetSliceMin();<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <span style='color:blue'>int</span> max =
imageViewer-&gt;GetSliceMax();<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  SliderRepres-&gt;SetMinimumValue(min);<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  SliderRepres-&gt;SetMaximumValue(max);<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  SliderRepres-&gt;SetValue(<span style='color:blue'>static_cast</span>&lt;<span
style='color:blue'>int</span>&gt;((min + max) / 2));<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'> 
SliderRepres-&gt;GetPoint1Coordinate()-&gt;SetCoordinateSystemToNormalizedDisplay();<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'> 
SliderRepres-&gt;GetPoint1Coordinate()-&gt;SetValue(0.92, 0.9);<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'> 
SliderRepres-&gt;GetPoint2Coordinate()-&gt;SetCoordinateSystemToNormalizedDisplay();<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  SliderRepres-&gt;GetPoint2Coordinate()-&gt;SetValue(0.92,
0.1);<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  SliderRepres-&gt;SetSliderLength(0.03);<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  SliderRepres-&gt;SetSliderWidth(0.03);<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  SliderRepres-&gt;SetEndCapLength(0.03);<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  SliderRepres-&gt;SetEndCapWidth(0.05);<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  SliderRepres-&gt;SetTubeWidth(0.005);<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  SliderRepres-&gt;SetLabelFormat(<span
style='color:#A31515'>&quot;%3.0lf&quot;</span>);<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  SliderRepres-&gt;SetTitleHeight(0.05);<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  SliderRepres-&gt;SetLabelHeight(0.05);<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  vtkSliderWidget *SliderWidget =
vtkSliderWidget::New();<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  SliderWidget-&gt;SetInteractor(iren);<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  SliderWidget-&gt;SetRepresentation(SliderRepres);<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  SliderWidget-&gt;KeyPressActivationOff();<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  SliderWidget-&gt;SetAnimationModeToAnimate();<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  SliderWidget-&gt;SetEnabled(<span
style='color:blue'>true</span>);<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  vtkSliderCallback2 *SliderCb =
vtkSliderCallback2::New();<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  SliderCb-&gt;SetImageViewer(imageViewer);<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  SliderWidget-&gt;AddObserver(vtkCommand::InteractionEvent,
SliderCb);  <o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>  imageViewer-&gt;SetSlice(<span style='color:blue'>static_cast</span>&lt;<span
style='color:blue'>int</span>&gt;(SliderRepres-&gt;GetValue()));<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-indent:12.0pt'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>imageViewer-&gt;SetSliceOrientationToXY();</span><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New"'><o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-indent:12.0pt'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-indent:12.0pt'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>SliderRepres-&gt;Delete();</span><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New"'><o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-indent:12.0pt'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>SliderCb-&gt;Delete();</span><span style='font-size:
10.0pt;font-family:"Courier New"'><o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-indent:12.0pt'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>iren-&gt;Start();</span><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'><o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal style='text-indent:12.0pt'><span style='font-size:10.0pt;
font-family:"Courier New"'>iren-&gt;Delete();</span><span style='font-size:
10.0pt;font-family:"Courier New"'><o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New"'>}</span><span
style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'><o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<div style='border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in'>

<p class=MsoNormal><b><span lang=ZH-CN style='font-size:10.0pt;font-family:
宋体'>发件人</span></b><b><span style='font-size:10.0pt;font-family:宋体'>:</span></b><span
style='font-size:10.0pt;font-family:宋体'> Jothy [mailto:jothybasu@gmail.com] <br>
<b><span lang=ZH-CN>发送时间</span>:</b> 2010</span><span lang=ZH-CN
style='font-size:10.0pt;font-family:"Batang","serif"'>ë…„</span><span
style='font-size:10.0pt;font-family:宋体'> 11</span><span lang=ZH-CN
style='font-size:10.0pt;font-family:"Batang","serif"'>ì›”</span><span
style='font-size:10.0pt;font-family:宋体'> 3</span><span lang=ZH-CN
style='font-size:10.0pt;font-family:"Batang","serif"'>일</span><span lang=ZH-CN
style='font-size:10.0pt;font-family:宋体'> </span><span lang=ZH-CN
style='font-size:10.0pt;font-family:"Batang","serif"'>수요일</span><span
lang=ZH-CN style='font-size:10.0pt;font-family:宋体'> </span><span lang=ZH-CN
style='font-size:10.0pt;font-family:"Batang","serif"'>오후</span><span
style='font-size:10.0pt;font-family:宋体'> 9:15<br>
<b><span lang=ZH-CN>收件人</span>:</b> Xiaopeng Yang<br>
<b><span lang=ZH-CN>抄送</span>:</b> vtk<br>
<b><span lang=ZH-CN>主题</span>:</b> Re: [vtkusers] Error message about vtk<o:p></o:p></span></p>

</div>

<p class=MsoNormal><o:p>&nbsp;</o:p></p>

<div>

<p class=MsoNormal style='margin-bottom:12.0pt'>You could post the code
snippet, so that ppl can look into it to help you better!<br>
<br>
Jothy<o:p></o:p></p>

<div>

<p class=MsoNormal>On Wed, Nov 3, 2010 at 11:54 AM, Xiaopeng Yang &lt;<a
href="mailto:yxp233@postech.ac.kr">yxp233@postech.ac.kr</a>&gt; wrote:<o:p></o:p></p>

<div>

<div>

<p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'><span
style='color:#1F497D'>Dear All,</span><o:p></o:p></p>

<p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'><span
style='color:#1F497D'>&nbsp;</span><o:p></o:p></p>

<p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'><span
style='color:#1F497D'>About the error message I mentioned in the last email.
Did anybody know what causes the probem?</span><o:p></o:p></p>

<p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'><span
style='color:#1F497D'>&nbsp;</span><o:p></o:p></p>

<p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'><span
style='color:#1F497D'>Best regards,</span><o:p></o:p></p>

<p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'><span
style='color:#1F497D'>Yang</span><o:p></o:p></p>

<p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'><span
style='color:#1F497D'>&nbsp;</span><o:p></o:p></p>

<div>

<div style='border:none;border-top:solid windowtext 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in;
border-color:-moz-use-text-color -moz-use-text-color'>

<p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'><b><span
lang=ZH-CN style='font-size:10.0pt;font-family:宋体'>发件人</span></b><b><span
style='font-size:10.0pt;font-family:宋体'>:</span></b><span style='font-size:
10.0pt;font-family:宋体'> <a href="mailto:vtkusers-bounces@vtk.org"
target="_blank">vtkusers-bounces@vtk.org</a> [mailto:<a
href="mailto:vtkusers-bounces@vtk.org" target="_blank">vtkusers-bounces@vtk.org</a>]
<b><span lang=ZH-CN>代表 </span></b>Xiaopeng Yang<br>
<b><span lang=ZH-CN>发送时间</span>:</b> 2010</span><span lang=ZH-CN
style='font-size:10.0pt;font-family:"Batang","serif"'>ë…„</span><span
style='font-size:10.0pt;font-family:宋体'> 11</span><span lang=ZH-CN
style='font-size:10.0pt;font-family:"Batang","serif"'>ì›”</span><span
style='font-size:10.0pt;font-family:宋体'> 3</span><span lang=ZH-CN
style='font-size:10.0pt;font-family:"Batang","serif"'>일</span><span lang=ZH-CN
style='font-size:10.0pt;font-family:宋体'> </span><span lang=ZH-CN
style='font-size:10.0pt;font-family:"Batang","serif"'>수요일</span><span
lang=ZH-CN style='font-size:10.0pt;font-family:宋体'> </span><span lang=ZH-CN
style='font-size:10.0pt;font-family:"Batang","serif"'>오전</span><span
style='font-size:10.0pt;font-family:宋体'> 10:22<br>
<b><span lang=ZH-CN>收件人</span>:</b> 'vtk'<br>
<b><span lang=ZH-CN>主题</span>:</b> [vtkusers] Error message about vtk</span><o:p></o:p></p>

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</div>

<p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'>&nbsp;<o:p></o:p></p>

<p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'>Hi
<o:p></o:p></p>

<p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'>&nbsp;<o:p></o:p></p>

<p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'>I
got the following error when I run a segmentation algorithm. Could anyone
explain the cause of this error?<o:p></o:p></p>

<p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'>&nbsp;<o:p></o:p></p>

<p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'>Thanks,<o:p></o:p></p>

<p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'>Xiaopeng<o:p></o:p></p>

<p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'>&nbsp;<o:p></o:p></p>

<p class=MsoNormal style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto'><img
border=0 width=501 height=188 id="_x0000_i1025"
src="cid:image001.png@01CB7B9D.A12B9120" alt=Untitled.png><o:p></o:p></p>

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