Hi all,<div><div><br></div><div>I am trying to extract surfaces from a MINC (.mnc) data file using vtkMarchingCubes. The code I am using is based on the VTK wiki&#39;s Marching cubes on a sphere example, and is as follows:</div>
<div><br></div><div>void marching_cubes() {</div><div><div>    vtkMINCImageReader* minc = vtkMINCImageReader::New();</div><div>    minc-&gt;SetFileName(&quot;/home/trash001/Desktop/AtlasGrey.mnc&quot;);        </div><div>
    </div><div>    vtkVoxelModeller* voxelModeller = vtkVoxelModeller::New();</div><div>    </div><div>    voxelModeller-&gt;SetSampleDimensions(197, 233, 189);</div><div>    voxelModeller-&gt;SetModelBounds(-98, 99, -134, 99, -72, 117);</div>
<div>    voxelModeller-&gt;SetScalarTypeToFloat();</div><div>    voxelModeller-&gt;SetMaximumDistance(.01);    </div><div>    voxelModeller-&gt;SetInputConnection(minc-&gt;GetOutputPort());</div><div><br></div><div>    vtkMarchingCubes* surface = vtkMarchingCubes::New();</div>
<div>    surface-&gt;SetInputConnection(voxelModeller-&gt;GetOutputPort());</div><div>    surface-&gt;ComputeNormalsOn();</div><div>    surface-&gt;SetValue(0, 0.5);</div><div><br></div><div>    vtkRenderer* renderer = vtkRenderer::New();</div>
<div>    renderer-&gt;SetBackground(.1, .2, .3);</div><div><br></div><div>    vtkRenderWindow* renderWindow = vtkRenderWindow::New();</div><div>    renderWindow-&gt;AddRenderer(renderer);</div><div>    vtkRenderWindowInteractor* interactor = vtkRenderWindowInteractor::New();</div>
<div>    interactor-&gt;SetRenderWindow(renderWindow);</div><div><br></div><div>    vtkPolyDataMapper* mapper = vtkPolyDataMapper::New();</div><div>    mapper-&gt;SetInputConnection(surface-&gt;GetOutputPort());</div><div>
<br></div><div>    vtkActor* actor = vtkActor::New();</div><div>    actor-&gt;SetMapper(mapper);</div><div><br></div><div>    renderer-&gt;AddActor(actor);</div><div><br></div><div>    renderWindow-&gt;Render();</div><div>
    interactor-&gt;Start();</div><div>    return;</div></div><div>}</div><div><br></div><div>When I run this code, I get a blank window. I suspect that the problem is that I cannot provide the MINC data to vtkMarchingCubes in a suitable format, but I could be wrong. Any help would be appreciated.</div>
<div><br></div><div><div>Thanks, </div>-- <br>Tanweer Rashid<br>Graduate Teaching &amp; Research Assistant<br>Department of Modeling, Simulation and Visualization Engineering<br>Old Dominion University<br><br>

</div>
</div>