<html>

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">

</head>

<body>

Hi, <br>

I have used itkbinarythinningfilter for 3d skeletonization of vascular structures. So, for 3d data you can use the same filter.

<br>

Best,<br>

Jaya

<hr style="display:inline-block;width:98%" tabindex="-1">

<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" style="font-size:11pt" color="#000000"><b>From:</b> vtkusers <vtkusers-bounces@vtk.org> on behalf of KitKat <johan.paasche@gmail.com><br>

<b>Sent:</b> Monday, January 22, 2018 1:11:22 PM<br>

<b>To:</b> vtkusers@vtk.org<br>

<b>Subject:</b> [vtkusers] Skeletonization 3D</font>

<div> </div>

</div>

<div class="BodyFragment"><font size="2"><span style="font-size:11pt;">

<div class="PlainText">Hello,<br>

<br>

I am looking for a tool able to extract the centerline (skeletonize) of a<br>

structure in a 3D image, if possible without changing length.<br>

<br>

What i am passing is a 500 * 500 * 500 vtkImageData composed of char either<br>

at 0 or 1 (binary Image),<br>

and i would like to thin it until I have a 1-voxel wide line structure<br>

corresponding to the centerline, or median axis of the input image.<br>

I know ITK has a thinningfilter, but after looking the source code i saw<br>

that it only take 2D images.<br>

<br>

Does someone know if such a tool exists and is compatible with VTK ?<br>

<br>

<br>

<br>

--<br>

Sent from: <a href="http://vtk.1045678.n5.nabble.com/VTK-Users-f1224199.html">http://vtk.1045678.n5.nabble.com/VTK-Users-f1224199.html</a><br>

_______________________________________________<br>

Powered by <a href="http://www.kitware.com">www.kitware.com</a><br>

<br>

Visit other Kitware open-source projects at <a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html">

http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br>

<br>

Please keep messages on-topic and check the VTK FAQ at: <a href="http://www.vtk.org/Wiki/VTK_FAQ">

http://www.vtk.org/Wiki/VTK_FAQ</a><br>

<br>

Search the list archives at: <a href="http://markmail.org/search/?q=vtkusers">http://markmail.org/search/?q=vtkusers</a><br>

<br>

Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>

<a href="https://vtk.org/mailman/listinfo/vtkusers">https://vtk.org/mailman/listinfo/vtkusers</a><br>

</div>

</span></font></div>

</body>

</html>